清原果耶さんの出身中学校は、地元・大阪府大阪市淀川区にある大阪市立美津島中学校であることが知られています。
中学校時代の彼女は、部活動として吹奏楽部に所属し、クラリネットを担当していました。部活動に熱心に取り組む一方で、学校行事の合唱コンクールなどでも積極的にリーダーシップを発揮する活発な生徒だったと伝えられています。
芸能界入りのきっかけとなったのは、2014年（中学1年生の秋）に開催された「アミューズオーディションフェス2014」でした。家族全員がテクノポップユニット・Perfumeの大ファンだったことから、母がオーディションに応募。応募総数3万2,214人の中から見事グランプリを受賞し、12歳にして芸能界への扉を開きました。
中学時代は上京せず大阪の実家から新幹線で東京の仕事場へ通う生活を続けており、学校生活とプロの現場を行き来する多忙な日々の中でも、義務教育をしっかりと修了しました。
卒アル写真の流出はある？ネット上の画像と素顔
インターネット上では「清原果耶の卒アル写真」とされる画像が一部で話題になったことがあります。美津島中学校時代と見られる制服姿の写真や集合写真が紹介された際、ファンの間では「中学生の時点ですでに圧倒的な完成度」「清楚さと凛とした目元が当時から変わらない」と大きな反響を呼びました。
一方、高校時代の卒業アルバム写真については一般への流出や公開は一切ありません。これは通信制高校のプライバシー管理が徹底していることや、学校行事への参加形態が全日制とは異なる点も関係しています。
