日本のカトリック教会の歴史は、1549年（天文18年）にイエズス会の宣教師フランシスコ・ザビエルが鹿児島に上陸したことから幕を開けました。戦国大名への布教を通じて九州や畿内を中心に信徒（キリシタン）が急増し、最盛期には当時の人口の約1〜2％に相当する数十万人規模に達したと記録されています。
豊臣秀吉のバテレン追放令や江戸幕府による禁教令、島原の乱を経て、日本におけるキリスト教は2世紀半以上にわたる徹底的な弾圧下に置かれました。しかし、長崎の浦上や五島列島などで厳しい弾圧を耐え抜いた「潜伏キリシタン（かくれキリシタン）」が信仰を密かに継承。1865年、長崎の大浦天主堂で起きた「信徒発見」は、世界の宗教史上でも稀に見る奇跡的な出来事としてバチカンを驚嘆させました。
明治期に入り信教の自由が保障されて以降、全国各地に小教区（パリッシュ）が設立されました。文化庁『宗教年鑑』の最新統計によると、日本国内のカトリック信徒数は約43万人（登録信徒数）で推移しています。さらに日本国内に滞在・就労するフィリピン、ブラジル、ベトナムなどの外国籍信徒を加えると実質的な教会共同体は60万人規模に上ると推計されており、国際色の豊かなコミュニティへと深化を遂げています。
