教育熱心な世帯が最も注目する要素の一つが、高学年における進路動向です。新宿区立東戸山小学校 中学受験の比率は年によって変動があるものの、例年約60%〜75%前後の児童が私立中・国立中・都立中高一貫校へ挑戦する傾向が見られます。これは東京都内の公立小学校平均(約20〜25%)を大きく上回る数値です。
地域指定の公立中学校としては新宿区立新宿中学校などへの進学が基本となりますが、男子校の早稲田・海城、女子校の桜蔭・女子学院、共学の広尾学園や都立白鴎など、都内屈指の難関校を目指して大手進学塾(SAPIX、早稲田アカデミー、日能研など)へ低学年・中学年から通塾する児童が珍しくありません。
受験する児童が多い環境は、「勉強することが当たり前」という空気がクラス内に醸成されやすいメリットがあります。一方で、新宿区立東戸山小学校 進学先中学校として公立中へ進む子どもたちに対しても、学校側は分け隔てなく基礎学力の定着と部活動や学校行事での活躍を促しており、過度な受験偏重にならないバランス感覚が保たれています。