阿笠博士黒幕説がこれほど長期間にわたって熱狂的に支持された背景には、読者の心理メカニズムとインターネット文化の発展が深く関わっています。
ミステリー愛好家の心理として、「最も怪しくない、最も身近な善人こそが真犯人である」というアガサ・クリスティの名作『アクロイド殺し』に代表される古典的衝撃を期待する傾向があります。コナンを無条件で助け、どこか抜けていて愛嬌のある阿笠博士だからこそ、「裏の顔があったときのカタルシスが最大になる」という読者側の無意識の願望が働いていたのは否定できません。
さらに、心理学でいう「確証バイアス」がネット掲示板の議論を加速させました。「阿笠が黒幕である」という仮説を一度信じ込むと、作中のあらゆる描写――例えば「博士がパソコンを操作しているコマ」「新一の行動を心配そうに見守る表情」――のすべてが「組織のボスとしての冷徹な監視」に見えてしまう現象です。ネット上の考察まとめや考察動画がアルゴリズムによって拡散される時代環境も、この集団的な確信を強化する要因となりました。