新宿バッティングセンターの利用システムは、極めて明快なコイン（または専用メダル・プリペイド）制です。一般的な1打席（1ゲーム）あたりの料金設定は1回約300円（20〜26球前後）となっており、都心の一等地にありながら非常にリーズナブルな価格設定が維持されています。
複数ゲームをガッツリ打ち込みたいプレイヤーやグループ利用向けには、まとめ買い用のプリペイドカード（例：1,000円〜3,000円単位）が用意されており、1ゲームあたりの単価をさらに抑えて楽しむことが可能です。ゲームセンター感覚で1コインからサクッと打てる手軽さは、現代のタイパ（タイムパフォーマンス）志向の若者にも強く支持されています。
また、同館の名物として外せないのが、バックスクリーン中央上部に掲げられた「ホームラン的」と連動したホームラン賞のシステムです。指定のターゲットに見事打球を直撃させると、けたたましいファンファーレとパトランプが点灯し、館内中から拍手が沸き起こります。見事ホームランを記録した打者には、記念品やプリペイドカードの贈呈、さらには館内ボードへの名前掲出といった名誉ある特典が授与されます。このレトロなアトラクション性が、単なるバッティング練習にとどまらない熱狂を生み出す起爆剤となっています。
