ボーちゃんの家庭環境もまた、作品内最大級のミステリーだ。野原しんのすけをはじめとする他の園児たちの親は日常的に作品へ登場するが、ボーちゃんの保護者が表舞台に立つことは極めて稀である。
テレビアニメの過去のエピソードにおいて、ボーちゃんの母親がわずかに登場した瞬間が存在する。後ろ姿のみ、あるいは手元だけの控えめな描写にとどまり、顔の全貌が明かされることはなかった。しかし、その立ち振る舞いや言葉遣いはきわめて上品で落ち着いており、ファンの間では「実は極めて裕福な良家の出身ではないか」「研究者の家庭だからこそあの知性が育まれたのでは」といった推測が飛び交っている。