日曜の夕方から夜にかけて現れる気分の落ち込み、頭痛、胃痛、不眠、強い焦燥感。これらのサザエさん症候群の症状と原因を紐解くと、人体のサーカディアンリズム（体内時計）の乱れと神経伝達物質の変動という明確な生理学的根拠に行き当たります。
最大の身体的要因として挙げられるのが、週末の起床・就寝時刻が平日とずれることで発生する「社会的時差ボケ（ソーシャル・ジェットラグ）」です。休日に2時間以上遅く起きる生活を送ると体内時計が後ろにずれ込み、日曜の夜になっても睡眠ホルモンであるメラトニンの分泌が促されません。その結果、副交感神経（リラックス）から交感神経（活動・緊張）への切り替えが破綻し、サザエさん症候群 自律神経の乱れが引き金となって動悸や冷や汗、胸苦しさといった不定愁訴が引き起こされます。
一方、精神医学的な側面から見ると、仕事に行きたくない 心理的理由の根底には「予期不安」と「心理的バウンダリー（自他境界）の侵食」が存在します。産業保健の現場に携わる精神科医らの臨床報告によると、週明けに待つノルマ、対人関係の軋轢、終わりの見えない業務量に対し、脳の扁桃体が「脅威」を先回りして検知し、防衛反応として抑うつ気分を発生させているのです。特に「真面目で責任感が強い人」ほど、休日であっても無意識に月曜日のタスクを反芻（はんすう）してしまい、自ら精神的負荷を増大させてしまう構造が浮き彫りになっています。
