夜行便を初めて利用する女性客にとって、隣席に誰が座るかは極めて深刻な懸念材料です。さくら高速バスでは、こうした防犯・プライバシー意識の高まりを受け、さくら高速バス女性専用車両および「女性安心エリア（女性専用席・後方エリア配置）」の設定路線を大幅に拡充しています。
女性専用便においては、乗客はもちろんのこと、車内アナウンスや改札時の配慮に至るまで女性の安心感を最優先した運用が行われます。一般の混乗便であっても、予約アルゴリズムによって「女性の隣には必ず同性の乗客を割り当てる」自動座席配分が基本原則として組み込まれています。
また、日本最大の高速バスターミナルであるバスタ新宿さくら高速バス乗り場においては、深夜時間帯でも警備員が常駐し、電光掲示板と改札システムによる厳格な誘導が実施されています。暗い路上待機場所でのトラブルリスクが完全に排除された拠点発着を選ぶことで、乗車前の心理的ストレスは大幅に緩和されます。
