心身の成長と豊かな人間関係を築く場として重要な大平南中学校の部活動ですが、現在は国および県が推進する「部活動の地域移行」の過渡期にあります。
同校には、野球部、サッカー部、ソフトテニス部、バスケットボール部、バレーボール部、バドミントン部、卓球部、陸上競技部などの運動部に加え、吹奏楽部や美術部などの文化部が設置されてきました。地区中体連の大会ではテニスや陸上、卓球などで上位入賞を果たす実績をコンスタントに残しています。
現在推進されている地域クラブ化・外部指導員の導入により、教員の過重労働是正と専門的なスポーツ指導の両立が図られています。休日の指導を地域のスポーツ団体や民間指導者が担う体制が段階的に整備されつつあり、生徒にとっては「学校の枠を超えて専門指導を受けられるメリット」が生まれる一方、参加費用や送迎といった保護者の役割調整が新たなテーマとなっています。