予約時に最も注意したいのが、同系列であるスマイルホテル那覇シティリゾートとの違いです。沖縄那覇店が「前島（泊港すぐ）」に位置するのに対し、シティリゾート店は「久米（波の上ビーチ方面）」にあります。タクシー移動時やマップ検索時に間違えやすいため、目的地（泊港発着の船に乗るかどうか）に応じた確認が必須です。
また、スマイルホテル沖縄那覇を最安値で予約する際は、各社OTA（オンライントラベルエージェント）のポイント還元キャンペーンや直前割引プランを比較検討するのが鉄則です。早期割を活用すれば、繁忙期前の平日などで驚くほどリーズナブルな宿泊枠を確保できる場合があります。
