湘南鎌倉総合病院への交通アクセスは、JR各線および湘南モノレールが乗り入れる大船駅が主要なターミナルとなります。駅からは無料シャトルバスや路線バスが運行されており、通院や面会の足として広く利用されています。
最も便利なのが、病院が運行する専用の無料送迎バスです。大船駅のシャトルバス乗り場は、駅西口交通広場のバスターミナル周辺（指定乗降場所）に設置されています。朝の通勤・通院ピーク時から夕方まで定時運行されており、乗車時間は道路状況にもよりますがおよそ10〜15分程度です。
路線バスを利用する場合は、大船駅西口バスターミナルから神奈川中央交通バス（「藤沢駅北口行き」や「船33系統」など）に乗車し、「湘南鎌倉総合病院」停留所で下車します。自家用車で来院する場合は敷地内に大規模な立体駐車場が完備されていますが、月曜午前などの混雑時間帯は入庫待ちの列が発生することもあるため、公共交通機関やシャトルバスの利用が推奨されます。
