高校選びで極めて重要な指標となるのが卒業後の進路実績です。三島南高校の進路状況を検証すると、約7割〜8割の生徒が4年制大学へ進学し、残りが短期大学、専門学校（看護・医療系含む）、公務員や就職という内訳になっています。
大学合格実績の内訳を見ると、国公立大学には毎年10名前後〜15名前後が合格しています。主な合格先は、静岡大学、静岡県立大学、都留文科大学などの近隣・近県公立が中心です。最難関の旧帝大を狙うには個人の突出した努力が必要ですが、地方国公立大学へのルートはしっかりと整備されています。
私立大学においては、首都圏の日東駒専（日本大学・東洋大学・駒澤大学・専修大学）をはじめ、神奈川大学、東海大学、東京農業大学、地元静岡の常葉大学などに多数の合格者を出しています。特筆すべきは「指定校推薦枠の充実度」です。歴史ある公立校として私立大学からの信頼が厚く、定期テストで評定平均4.0以上をキープしていれば、有名私大への推薦枠を獲得できるチャンスが十分に用意されています。
