こうした多岐にわたる競技会運営や強化事業を背後で支えているのが、連盟の強固な役員・組織概要です。競泳委員会、飛込委員会、水球委員会、アーティスティックスイミング委員会、さらにはオープンウォータースイミング（OWS）や医事・科学委員会など、専門分野ごとに組織化された委員会が機能しています。
公認審判員の養成や競技役員の派遣、安全管理の徹底など、ボランティアを含む多くの役員・指導者の献身的な活動によって、公正かつ安全な大会運営が維持されています。コンプライアンスの遵守や指導現場でのアンチ・ドーピング教育など、健全なスポーツ環境づくりにも継続的な配慮が払われています。
