宿泊予約時に最も頭を悩ませるのが「客室タイプの選定」です。アクアフォレストの宿泊エリアは大きく「ホテル本館」と「森の中に点在するヴィラ（コテージ）」の2つに分かれています。
利便性を最優先するなら、ホテル本館の「スタンダードツイン」や「和洋室」がおすすめです。レストラン、大浴場「ともやまの湯」、アクアパレス、ロビーのすべてが同一棟または直結通路で移動できるため、移動の負担が一切ありません。特に小さな子ども連れや高齢の同伴者がいる旅行では、本館を選ぶのが最も安心かつ快適です。
一方、グループ旅行や非日常のプライベート感を満喫したい層には、森に佇む「メゾネットコテージ」が圧倒的な支持を得ています。最大5名〜6名まで宿泊できる2階建て構造となっており、吹き抜けのリビングと独立したベッドルームを備え、まるで別荘を貸し切ったかのような贅沢な滞在が叶います。
さらに愛犬家から絶賛されているのが、犬同伴専用の「ペットコテージ（ドッグコテージ）」です。ケージや専用ゴミ箱、食器、消臭スプレーなどの愛犬用アメニティが完備されており、コテージ周辺の緑豊かな散策路をリード着用で愛犬とともに散策できます。宿泊記のリアルな声によると、「周囲を気にせず愛犬とのびのび過ごせた」「本館へ行く間は部屋のケージでお留守番をさせられるので便利だった」と好評である一方、「本館までの移動距離が徒歩5〜7分ほどあるため、移動用カートや雨具の準備は必須」というアドバイスが共通して挙げられています。
