多くの人が最も気にかけていたのが「新潟行方不明中学生発見場所はどこだったのか」という点です。捜査関係者の情報によると、生徒が発見されたのは自宅から一定の距離が離れた幹線道路沿いの商業施設付近でした。
行方不明中学生発見時の状況について、巡回中の警察官が服装や身体的特徴の一致する人物を発見し、慎重に声をかけたところ本人と確認されました。発見当時、生徒は一人でベンチに腰掛けており、パニック状態や目立った暴行の痕跡などは見受けられなかったとされています。
行方不明保護された場所は人通りのあるエリアだったものの、夜間や早朝は人目が途切れやすい死角も存在していました。目撃者からは「少し疲れた様子で歩いていた」「雨風をしのげる軒下にいたようだ」といった証言も寄せられており、過酷な状況下で自力で移動を続けていたとみられます。