「目の前にいる個体がどちらなのか」を判別したい場合、確認すべきポイントはわずか3つに絞られます。生息エリア、お腹の色、そして足の裏の構造です。この3点さえ頭に入っていれば、野外や室内で遭遇した際に迷うことはありません。
もっとも分かりやすい外見の識別基準が「腹部の色」です。日本本土に広く生息するアカハライモリは、その名の通りお腹全体が鮮烈な赤色や朱色をしており、黒い斑点模様が散らばっています。これは自然界において捕食者へ警告を発する「警戒色」です。対してニホンヤモリのお腹は、背中側と同じく白に近い淡いクリーム色や薄い灰色をしており、派手な配色は一切見られません。
2つ目の基準は「皮膚の質感」です。両生類であるイモリは皮膚呼吸を行う関係上、常に湿り気があり、ツルツル、あるいはしっとりとした触感を保っています。水辺を離れて長時間乾燥した環境に置かれると命に関わります。一方、爬虫類であるヤモリは体内の水分蒸発を防ぐウロコで覆われており、表面はサラサラ・ザラザラとして完全に乾いています。
そして3つ目が「垂直なガラスや壁を登れるかどうか」です。ヤモリの指先には特殊な微細構造が備わっており、ツルツルの窓ガラスでも難なく垂直歩行できます。もし民家の網戸やガラス窓、天井付近に張り付いているなら、その時点で100%ヤモリと断定して間違いありません。イモリには壁に張り付く能力はなく、田んぼや小川、池などの水中や水辺の湿ったコケの上を這うように歩きます。
名称の混同を防ぐには、古くから伝わる「漢字の覚え方」を理解しておくのが最も合理的です。
・イモリ（井守）：「井戸を守る」と書きます。井戸や水田といった「水場」に棲み、水中の害虫を食べることからこの名がつきました。水が必要な生き物＝両生類と結びつけると記憶に定着します。
・ヤモリ（家守・屋守）：「家を守る」「屋敷を守る」と書きます。民家の外壁や室内に現れ、明かりに集まるシロアリや蛾、ハエなどの害虫を捕食してくれることから、古来より家の守り神として扱われてきました。家屋の壁を登る＝爬虫類と整理できます。
