日本海側の気候は変わりやすく、旅行中の急な悪天候に見舞われるケースも少なくありません。しかし、越前松島水族館は天候に左右されにくい構造を持っています。
越前松島水族館 雨の日の見どころとして挙げられるのは、敷地内に点在する独立した屋内パビリオン群です。「海洋館」「うみがめ館」「さんごの海」「こんぺいとうハウス」「クラゲ展示館」など、主要な展示棟はすべて完全屋内です。館と館の間の移動時に折りたたみ傘が必要となる程度で、雨天時でも館内の観察や餌やり体験、水面浮遊体験は何ら支障なく楽しむことができます。さらに通年で鑑賞できる大型のマンボウ展示も屋内に位置しており、雨の日でもゆったりとマイペースに泳ぐ巨体を間近で観察できます。
観光ルートとしての利便性も抜群です。東尋坊 越前松島水族館 アクセスは、車であれば海岸沿いの県道を北上してわずか約5分〜7分（約4.5km）。公共交通機関を利用する場合でも、東尋坊バス停から京福バスに乗車すれば約10分で水族館前バス停へ直通します。また、北陸新幹線の停車駅であるJR「芦原温泉駅」からも路線バスで約30分、車で約20分という好立地です。
半日楽しんだ後の食事処として外せないのが、越前松島水族館 周辺ランチグルメです。水族館が位置する三国町は、全国的にも名高い「三国港」を擁する美食の宝庫。周辺には徒歩や車で数分の距離に、新鮮な海の幸を惜しみなく盛り付けた海鮮丼や、冬の味覚である越前ガニを堪能できる名店（「みくに隠居処」「越前蟹の坊」「お食事処 田島」など）が立ち並んでいます。朝一番で水族館を満喫し、昼に三国港の極上海鮮に舌鼓を打ち、午後に東尋坊の絶景を巡るルートは、福井観光における黄金コースと言えます。
