船橋市教育委員会の意思決定と実行体制を理解する上で欠かせないのが、教育委員会事務局の組織図とその指揮系統です。教育長を頂点に、教育総務部（総務課、学務課、施設課など）と生涯学習部、そして学校教育の中枢を担う学校教育部が配置されています。
中でも指導課は、市内公立小・中・特別支援学校の教育課程の編成、教職員の指導力向上研修、いじめ防止対策などを直接管轄する最重要セクションです。現場の教員からは「指導課による初任者研修プログラムの充実度が、近隣自治体と比較しても手厚い」という声が聞かれます。
また、歴代の船橋市教育長の系譜を紐解くと、学校現場の校長出身者と行政実務に長けた事務方出身者がバランスよく登用されてきた経緯があります。現場の苦悩を熟知したリーダーシップのもとで「地域に開かれた学校づくり」が推進され、コミュニティ・スクール（学校運営協議会制度）の導入率向上へと結びついています。市民からの各種手続きや相談窓口となる問い合わせ窓口（学区相談、就学援助、教育相談等）の一元化も、こうした組織ガバナンス改善の一環として機能しています。
