JR東西線のダイヤを読み解く鍵は、両端の駅からの広域な直通運転にあります。東側の京橋駅からは学研都市線（片町線）の同志社前・木津方面へ、西側の尼崎駅からはJR宝塚線（福知山線）の新三田・篠山口方面、およびJR神戸線（東海道・山陽本線）の西明石方面へとシームレスに直通しています。
東西線内では各駅に止まる列車も、直通先の路線に入った瞬間に種別ごとの通過運転が始まります。主なJR宝塚線直通の快速停車駅および学研都市線内の停車パターンは以下の通りです。
▼ 尼崎以西（JR宝塚線内）の快速停車駅：
尼崎 ─ 伊丹 ─ 川西池田 ─ 中山寺 ─ 宝塚 ─ 西宮名塩 ─ 三田 ─ （以降、新三田・篠山口方面の各駅）
※塚口、猪名寺、北伊丹などは快速が通過するため、普通列車への乗り換えが必要です。
▼ 京橋以東（学研都市線内）の快速停車駅：
京橋 ─ 放出 ─ 住道 ─ 四条畷 ─ 星田 ─ 河内磐船 ─ 長尾 ─ （以降、木津方面の各駅）
※鴫野、徳庵、鴻池新田などは普通列車のみ停車します。
このように、「乗ったときは各駅停車感覚でも、地下を出ると一気に通過駅が増える」のが東西線直通便の特性です。目的地が直通先の中小駅である場合は、尼崎駅や京橋駅での種別確認が必須となります。
