車でのアクセス利便性が非常に高いこともMEGAドン・キホーテ柏崎店の強みです。店舗は幹線道路である国道8号線沿い（宝町エリア）に位置しており、柏崎市中心部はもちろん、長岡方面や上越・刈羽方面からの往来もしやすい好立地にあります。
敷地内には広大な無料駐車場が整備されており、平面駐車場と立体駐車場の双方が利用可能です。雨天や雪の日でも濡れずに店内へ入れる立体駐車場は、天候が崩れやすい新潟の冬場や梅雨時期に重宝します。ただし、土日祝日のピークタイム（14:00〜18:00頃）は国道8号線からの右折進入車で周辺道路が詰まりやすくなる傾向があります。混雑時間帯はあらかじめ手前の交差点から裏手の生活道路へ迂回し、側面側の出入口からスムーズに進入するのがおすすめです。
