茨城県の公立高校入試（共通選抜）において、藤代高校は県南エリアにおける確かな中核進学校として位置づけられています。大手模試機関および茨城県教育委員会の公表資料を総合すると、藤代高校の偏差値は58前後で安定しており、学力上位層が厚く集まるゾーンを形成しています。
近年の藤代高校の倍率動向を見ると、普通科の定員に対して1.10倍〜1.25倍の間で推移しています。近隣の牛久栄進高校や取手第一高校、竜ヶ崎第一高校との志願者流動はあるものの、交通アクセスの利便性や文武両道のブランド力から極端な定員割れや極端な高倍率の乱高下が起きにくく、毎年安定した人気を保っているのが特徴です。
受験生が最も気にする藤代高校の合格点ボーダーについては、500点満点の学力検査において360点〜375点がひとつの安全圏ラインとされています。内申点（調査書評定）は3学年合計で100〜110点（オール3.7〜4.0以上）がボリュームゾーンであり、当日の学力検査重視の選抜枠があるとはいえ、日頃の定期テストや提出物対策を疎かにしない堅実な準備が求められます。
