ホテルグレイスリー新宿の代名詞とも言えるのが、東宝との強力なタイアップによって実現したコンセプトルームです。ここには大きく分けて2種類のゴジラ関連客室が存在し、予約時の仕様や体験内容が大きく異なります。
最上階30階に位置する1室限定の「ゴジラルーム」は、足を踏み入れた瞬間から映画の特撮世界に没入できるスペシャルルームです。歴代ゴジラの巨大スタチューや特殊ギミック、壁面のジオラマ演出が施されており、宿泊者しか手に入らない限定デザインのゴジラグッズ（オリジナルフィギュアやアメニティポーチ等）が進呈されます。公式予約サイトでも数カ月先まで満室が続くプレミアム枠となっています。
一方、8階テラスにそびえ立つほぼ実物大の「ゴジラヘッド」を客室の窓から正面に眺められるのが「ゴジラビュールーム（シングル／ツイン）」です。夜間にライトアップされ、定期的に咆哮とともに煙を吐き出すゴジラヘッドを至近距離で独占できる贅沢なアングルが人気を集めています。
一般の宿泊客であっても、8階テラスの「ゴジラヘッド見学デッキ」へ立ち入ることが可能です。かつては入場制限が厳格でしたが、現在は宿泊者および8階カフェテラス「ボンジュール」の利用者に公開されており、目の前で記念撮影を楽しむことができます。迫力あるアングルを狙うなら、夕暮れから夜間のライトアップ演出スケジュール（毎正時などの発光・咆哮タイム）に合わせた見学がおすすめです。
