物語の終盤、シオンは世界を覆う「忘却の霧」の発生源が、かつて他者との関わりを拒絶したシオン自身の深層心理そのものであったという残酷な事実に直面します。本作には大きく分けて3つのエンディングが存在します。
通常ルートで到達する「孤立エンド」では、他者との摩擦を恐れて再び自室へ閉じこもり、安全だが静止した日常へと回帰します。一方、仲間との信頼度を高めた状態で挑む「融和エンド」では、街の住人たちと手を取り合って霧を晴らし、一見ハッピーエンドに見えるものの、どこかシオンが他者に依存しすぎている危うさを残します。
そして、特定のマップで手に入る「4つの古びた記憶の欠片」を集め、特定の夜間イベントを踏破することで解放される「真エンディング（境界の受容）」が、本作を名作たらしめている決定的な要素です。
このルートにおいてシオンは、他者と完全に同化することも、完全に拒絶することも選ばず、「孤独であることを認めた上で、他者の痛みに寄り添う」という第三の道を提示します。メタフィクション的な演出として、プレイヤーが入力したプレイ開始時の名前とシオンの意識が対話するシーンは、コミュニティ内でも「近年稀に見る名演出」として絶賛されています。
