『ドラゴン桜2』には、一般的な連続ドラマのようなJ-POPの主題歌が存在しません。これは近年の日曜劇場が採用している重厚なドラマツルギーの一環であり、劇伴音楽（劇中歌・BGM）がその役割を担っています。
本作の音楽を担当したのは、数々の名作アニメやドラマを手掛けてきた作曲家・林ゆうきです。専科の生徒たちが試練に立ち向かう緊迫したシーンで流れるストリングスや、逆転劇の口火を切る高揚感溢れるオーケストレーションは、視聴者の没入感を極限まで高めました。主題歌のタイアップに依存せず、劇伴の力だけで物語の熱量をコントロールした構成は、ドラマ批評家の間でも高く評価されています。
