南大阪病院へのアクセスは、公共交通機関およびマイカー双方からのアクセス性に優れています。最寄り駅は大阪メトロ四つ橋線「北加賀屋駅」や「玉出駅」、南海本線「住之江公園駅」「粉浜駅」など複数路線からアプローチ可能で、最寄り停留所を経由する大阪市営バスの利用も便利です。
お車で来院される方向けには、敷地内および隣接地に立体・平面のコインパーキングが完備されています。南大阪病院の駐車場料金は、外来受診や入退院の付き添いであれば割引処理を受けることで割安に利用できます。ただし、月曜日や連休明けの午前中は駐車場入口で入庫待ち列が発生することがあるため、時間に余裕を持った移動が求められます。