神仏習合の濃密な空気を今に伝える社歴は、飛鳥時代にまで遡る。主祭神として祀られているのは、水と美、そして芸能を司る市杵島姫命（いちきしまひめのみこと）だ。だが、この地の歴史を語る上で欠かせないのが、大峯山・修験道の開祖である役小角（えんのおづぬ）の存在である。
役小角が大峯山を開山した際、最高峰の弥山（みせん）に弁財天を祀ったのが神社の起源とされる。神社本庁に属しながらも、寺院の護摩焚きや密教的儀礼の痕跡を色濃く残す特異な神仏調和の形式は、過酷な山岳信仰の拠点として発展した歴史の証左にほかならない。
