現在の大井町線において、多くのビジネスパーソンが頭を悩ませるのが朝ラッシュ時の激しい混雑と慢性的な遅延です。朝8時前後の上り（大井町方面行き）は、自由が丘駅や大岡山駅で目黒線・東横線から流入する客と、田園都市線から直通してくる通勤客が重なり、ピーク時の混雑率は140%前後に達します。
大井町線が遅延を引き起こしやすい背景には、路線特有の「3つの構造的要因」が存在します。
第一に、自由が丘駅・大岡山駅・旗の台駅での乗降過密による停車時間超過です。短時間で大量の乗客が乗り降りするため、ドアの再開閉が連鎖し、後続の急行・各停が駅手前で信号待ちを余儀なくされます。
第二に、住宅密集地を貫く路線ならではの「踏切安全確認」です。大井町線の東側区間（大井町〜荏原町間など）には今なお複数の踏切が残存しており、直前横断や非常ボタン押下による防護発令が全線のダイヤを直撃します。
第三に、田園都市線直通運転のあおり運転影響です。直通する急行列車が田園都市線側で発生した遅延を引きずり、そのまま大井町線内のダイヤへ波及するケースが後を絶ちません。東急電鉄の公式アプリや「東急線運行情報（リアルタイム）」を活用し、運行障害発生時には大岡山から目黒線経由へ迂回するなど、複線的なルート選択を即座に行える構えが求められます。
