春の満開期や冬のイルミネーション期間中は、周辺道路および駐車場が著しく混雑します。敷地内には普通車約580台収容の大型有料駐車場（1回200円）が完備されていますが、最盛期の土日祝日は午前10時過ぎから満車となり、県道48号線（舘山寺街道）に長い入庫待ち列が発生します。
混雑を完全に回避するための鉄則は、「開園直後（8:30〜9:00頃）の到着」です。朝一番に入園すれば、澄んだ朝光の中で混雑のないチューリップ畑の撮影が可能なうえ、出庫時の渋滞にも巻き込まれません。また、園内は高低差があるため、足腰に不安のある方や小さな子ども連れは、園内を周遊するガイド付きバス「フラワートレイン」（大人1回100円〜）を賢く利用することで、体力を消耗せずに広大な園内を満喫できます。
公共交通機関を利用する場合、JR浜松駅北口バスターミナル1番乗り場から遠鉄バス「舘山寺温泉行き」に乗車し、約40分の「フラワーパーク」停留所で下車するのが標準ルートです。舘山寺温泉の宿泊施設からは車でわずか5分程度、徒歩でも20分前後の好立地にあるため、温泉街に前泊して朝一番にフラワーパークを散策するルートが最もストレスフリーな旅程設計といえます。
