通勤・通学時間帯に湖西線の大津京〜堅田〜小野間などで足止めを食らった場合、JR西日本が手配する振替輸送の活用が現実的な脱出手段となります。湖西線の運行障害時には、主に以下の交通機関へ振替が行われます。
【主な振替輸送受託事業者・路線】
・京阪電車：京津線（御陵〜びわ湖浜大津）、石山坂本線（石山寺〜坂本比叡山口）
・京都市営地下鉄：東西線（太秦天神川〜六地蔵）
・京阪バス・江若交通：指定された駅間を結ぶ路線バス
利用時の注意点として、振替輸送の対象となるのは「運転見合わせ区間の乗車券」「磁気定期券」「ICOCA定期券（定期区間内）」を所持している乗客に限られます。交通系ICカードの残額利用（チャージ残高での乗車）は振替輸送の対象外となるため、他社線を利用する場合は別途運賃の支払いが必要です。駅の改札口で配布される振替票や駅係員の案内を確認し、SuicaやICOCAのタッチを行わずに係員通路を通過するのが正規の入場手順となります。
