新秋津駅の構造は非常にシンプルで、地下にある対向式ホーム2面2線から階段またはエレベーターで地上1階の改札口へ上がるレイアウトとなっています。駅構内図を事前に把握しておけば、迷う要素はほぼありません。
改札外にはコインロッカーが設置されており、所沢や武蔵野エリアへの出張・観光時の手荷物預け入れに重宝します。また、駅前ロータリーからは西武バスの所沢駅東口行きや久米川駅行きなどのバス路線が発着しており、鉄道だけでなく路線バス網を使った多角的な移動が可能です。
周辺のインフラ環境として、通勤通学客向けの市営・民営の駐輪場やコインパーキングが駅周辺に点在しています。特に自転車利用者は多く、駅直近の定期利用駐輪場は満車になりやすいため、利用を検討している場合は早めの空き確認が推奨されます。
