日常的に使う上で最大のストレスとなりがちなのが、使用後のお手入れです。ストロー内部や細かなジョイント部分は湿気がこもりやすく、茶渋やカビが発生しやすい環境にあります。
衛生的に長く使い続けるためには、分解パーツが少なくシンプルな構造の製品を選ぶのが鉄則です。パッキンとフタが一体化しているものや、食洗機・煮沸消毒・薬液消毒（ミルトン等）に対応している製品を選ぶと、日々のメンテナンス負荷が格段に軽くなります。
ストロー部分の洗浄には、専用の細口ストローブラシを使うのが基本ですが、日々の洗浄が負担な場合は市販の使い捨てストロー（500ml対応のロングタイプ）に付け替え可能なモデルを選択するのが最も合理的です。飲み口のキャップ部分だけをしっかり洗い、ストローは毎回新品に取り替える運用にすることで、常に衛生的な状態を保てます。
