スポーツ強豪校としてのイメージが先行しがちですが、近年の阪南大高校の進学実績は着実な伸長を見せています。大学進学率は80％を超え、進路の多様化が進んでいます。
特進コースSおよびAの指導強化に伴い、大阪公立大学や和歌山大学をはじめとする国公立大学への現役合格者がコンスタントに出ているほか、関関同立へは毎年30〜50名前後、産近甲龍へは100名を超える合格実績を記録しています。特進コースでは朝の小テストや放課後講習、長期休暇中の進学講座が体系化されており、大手予備校に過度に依存せずとも一般入試を戦い抜ける学習支援体制が構築されています。
一方、総合進学コースの生徒にとって最大の強みとなるのが、系列である阪南大学への優先的な「内部推薦制度」です。全体の約30〜40％前後の生徒が阪南大学の各学部（国際学部、経済学部、流通学部、経営情報学部など）へ進学しており、高校3年間の評定平均値や面接などの条件をクリアすることで、早い段階で進路を確定させることが可能です。さらに、関西圏の中堅〜上位私立大学からの指定校推薦枠も多数保有しており、「一般入試のプレッシャーを回避して手堅く大学へ進学したい」と考える層にとって非常に手厚い受け皿となっています。
