箱根海賊船の桃源台港を利用するにあたり、まず頭に入れておくべきなのは「駅と港が完全に一体化したシームレス構造」と「季節・天候による運航ダイヤの変動幅」です。
桃源台ターミナルは、箱根ロープウェイの終点「桃源台駅」、箱根海賊船の「桃源台港」、さらに新宿や小田原を結ぶ各種高速バス・路線バスの発着所が地下1階から地上2階までのフロアに集約されています。移動に階段の上り下りや長距離歩行を必要としないため、家族連れや大きなスーツケースを持つインバウンド客にとっても極めて利便性の高い設計が特徴です。
箱根海賊船の桃源台港発着の時刻表は、通常ダイヤで日中約30〜40分間隔で運航されています。午前9時台から夕方16時〜17時台までが基本の運航枠ですが、気象条件（特に芦ノ湖特有の濃霧や強風）によって急遽ダイヤが変更されるケースが少なくありません。現地の電光掲示板だけでなく、スマートフォンから箱根海賊船の運航状況をリアルタイムで把握できる公式Webサイトのチェックは、出発前の必須ステップと言えます。
