中央学院高校を語る上で欠かせないのが、全国屈指の実績を誇る部活動の存在です。特に中央学院高校野球部は、2026年春の第96回選抜高等学校野球大会（甲子園）において、巧みな機動力と勝負強い打撃、堅牢な守備力を武器に快進撃を続け、全国ベスト4という歴史的快挙を成し遂げました。
同校野球部の強さの根底にあるのは、長年チームを率いる指導陣による「徹底した人間的成長と自主性の尊重」です。厳しい規律だけで縛るのではなく、選手自身が状況を判断して動くシンキング・ベースボールが定着しています。専用の野球場や雨天練習場、充実したウェイトトレーニング施設など、私立ならではのハイレベルなハードウェアが選手の潜在能力を引き出しています。
野球部に劣らず高い評価を受けているのが中央学院高校サッカー部です。強豪がひしめく千葉県内において、市立船橋や流通経済大柏といった全国トップクラスの壁に挑み続け、千葉県1部リーグ（U-18）や全国高校総体（インターハイ）予選、高校選手権予選で幾度も上位進出を果たしています。人工芝グラウンドを備えた恵まれた練習環境の中、パスワークとインテンシティを融合させた現代的なサッカーを展開しています。
このほか、駅伝部やゴルフ部、吹奏楽部など多種多様な部活動が活発に活動しており、学校全体にエネルギーと活気が満ちています。
