円錐角膜を早期に見つけ出すためには、一般的な視力検査や眼底検査だけでは不十分です。専用機器を用いた円錐角膜の検査方法として欠かせないのが「角膜形状解析装置（トポグラフィー）」や「前眼部OCT」です。これらの検査機器を用いることで、角膜表面のわずかな歪みや厚みの分布をミクロン単位のカラーマップで可視化し、自覚症状が出る前の超初期段階であっても的確に診断できます。
屈折矯正手術を検討する際に極めて重要な注意点として挙げられるのが、円錐角膜におけるレーシック禁止の原則です。レーシックは角膜実質層をレーザーで削って屈折力を変える手術ですが、角膜の厚みと剛性を削ぐことになります。もし円錐角膜の素因を持つ人がレーシックを受けると、残された角膜強度が眼圧に耐えられず、急激に角膜が突出する「医原性角膜拡張症（エクタジア）」を引き起こし、深刻な視力障害に陥る危険があります。そのため、屈折矯正手術前の事前スクリーニング検査は厳格に行われています。
