半蔵門線が遅延する最大の理由は、東急田園都市線および東武スカイツリーライン・日光線・伊勢崎線との大規模な相互直通運転にある。神奈川県の中央林間から埼玉県・栃木県の久喜・南栗橋まで、総延長は100キロメートルを大幅に超える。どこか一箇所で踏切点検やドア挟まりが発生すれば、その遅延波は数分とたたずに半蔵門線内へと侵入してくるのだ。
特に朝のピーク時間帯は、わずか2〜3分の遅れが後続列車に次々と連鎖する。相互乗り入れは利便性を極限まで高めた反面、どこか一箇所のトラブルが全線に波及する構造的な脆さを抱えている。
