多くの通勤・通学者が疑問を抱く最大の焦点が、「なぜ定期券は振替輸送が使えるのに、チャージしたSuicaやPASMO残額での乗車は使えないのか？」という点です。これには鉄道営業における運送契約の成立タイミングという法的な壁が存在します。
鉄道会社各社（JR東日本、東京メトロ、大手私鉄各社など）の共通規定によると、振替輸送の対象となる条件は「運行不能となる前に、目的地までの有効な乗車券（契約）をすでに購入・所持していること」と定められています。
紙の普通乗車券、回数券、そして通勤・通学定期券は、購入時点または乗車駅に入場した時点で「発駅から着駅まで」の区間契約が成立し、運賃が確定（または事前決済）しています。そのため、鉄道会社側には「契約した目的地まで責任を持って送り届ける義務」が発生し、その義務を果たす代替手段として他社路線への振替費用を運行不能会社が負担します。
一方、ICカードのストアードフェア（SF：チャージ残額）利用は、入場駅を記録した段階では目的地が確定していません。出場駅の自動改札機にタッチした瞬間に初めて降車駅までの運賃が引き落とされ、運送契約が完結するシステムです。つまり、運転見合わせが発生した時点では「どこまで行く予定だったのか」を客観的に証明する契約が存在せず、振替輸送の対象外（自発的な途中出場・別ルート利用扱い）となります。
