ホテルシーサイド島原の温泉における最大の特徴は、敷地内の地下深くから湧出する自社源泉の遊離炭酸含有量にあります。日本の温泉法で「炭酸泉」と定義される基準値（1kg中250mg以上）を遥かに凌駕し、人工炭酸泉とは異なる天然由来ならではの柔らかな肌触りと強力な浸透圧を誇ります。
炭酸ガスが皮膚から直接吸収されることで毛細血管が拡張し、血行促進・冷え性改善・筋肉疲労の早期回復といった顕著な温浴効能をもたらします。ぬるめの適温でありながら、短時間の入浴で体の芯からポカポカと温まり、湯上がりの持続的な保温効果には定評があります。
近年急速に熱を帯びるサウナ需要に対しても、抜かりのない設計が施されています。適度な湿度を保ったドライサウナで芯まで温まった後、しっかりと冷やされた水風呂へ。露天エリアに設置された外気浴スペースでは、有明海から吹き抜ける潮風を浴びながら、贅沢な「ととのい」の境地へと導かれます。
また、プライベートな空間で気兼ねなく名湯を堪能したい層に向けて、貸切温泉（家族風呂）が複数室用意されています。広々とした内湯とオーシャンビューの露天を備えた贅沢な造りとなっており、小さな子ども連れのファミリーや介助が必要なシニア層、カップルから絶大な支持を集めています。日帰り温泉利用時でも家族風呂の予約が可能であり、週末の利用には事前確認が推奨されます。
