コガネムシとカナブンが園芸界・農業界において明確に区別される最大の理由は、その食性に起因する生態系上のポジションにあります。コガネムシは植物組織を破壊する「一次消費者（植食性害虫）」であり、カナブンは有機物を土へと還す「分解者（腐食性益虫）」です。
成虫のコガネムシは、サクラ、バラ、ブルーベリー、ブドウ、大豆など幅広い植物の葉を主食とします。特に集団で飛来したコガネムシは、葉脈だけを残して網目状に葉を食べ尽くすため、光合成能力を奪われた植物は生育不良に陥ります。さらに深刻なのは産卵行動です。成虫は柔らかい園芸用土や畑の土中に潜り込み、1匹あたり数十個の卵を産み落とします。
一方、カナブンが植物の健全な生葉や根を食べることは構造上あり得ません。口器はブラシ状になっており、樹液や発酵した果汁を吸い上げることに特化しています。自然界においてカナブンは、クヌギやコナラの樹液場に集まり、カブトムシやオオクワガタなどとともに樹液環境を共有する無害な住人です。生きた植物組織を噛み砕く頑強な大顎を持たないため、庭木にとまっているカナブンを無理に駆除する必要は一切ありません。
