京都市美術館の展覧会スケジュールをチェックする際、押さえておくべきは展示エリアごとの明確なコンセプトの違いです。館内は主に以下の3つの主要ゾーンで構成されています。
第一に、歴史的な大空間を活かした「本館」では、国内外の一級コレクションを集約した大型企画展や、同館が誇る名品を展示する「コレクションルーム」が展開されます。常設展示に近いコレクションルームでは、四季折々の京都画壇（竹内栖鳳、上村松園など）の名作が定期的に展示替えされ、静謐な空間で鑑賞できます。
第二に、新館の「東山キューブ」は、天井高約5メートルの無柱空間を活かし、現代アート、建築、ファッション、メディアアートなど最先端の表現を発信する場として機能しています。世界的な現代アーティストの大規模個展や国際展が開催されるメインステージです。
第三に、本館の北西側、道路を挟んだロームシアター京都の隣に位置する「京都市美術館 別館」（旧京都市公会堂東館）も見逃せません。ここでは公募展や教育普及プログラム、京都ゆかりの気鋭の作家による実験的な展示が頻繁に行われており、本館とは異なるローカルかつ濃密な芸術体験を提供しています。
