正規料金からさらに支出を削るための割引施策も複数用意されています。代表的なのが、交通機関とセットになった「得Q PACK」などの高速バス・電車往復乗車券付きフリーパスです。首都圏や東海エリアから公共交通機関で訪れる場合、個別に切符を手配するより実質数千円単位の節約につながります。
また、CLUBフジQ会員限定で定期的に配信されるメルマガクーポンや、各種クレジットカードの優待特典、福利厚生サービス（ベネフィット・ステーション、リロクラブ等）の優待枠も見逃せません。事前の会員登録やクーポンコードの適用だけで、数百円から千円程度の割引が即時反映されます。
障がい者割引についても手厚く整備されています。身体障がい者手帳、療育手帳、精神障がい者保健福祉手帳（またはミライロID等のデジタル手帳）を提示することで、本人および同伴者1名まで割引価格でのフリーパス購入が可能です。詳細な適用条件や専用窓口での手続きの流れについては、来園前に公式サイトの案内を確認しておくと当日の案内がスムーズです。
