南流山中学校の教育水準を測る重要な指標の一つが進学実績です。流山市全体の学力水準の高さと比例するように、卒業生の進路先は県内公立トップ校から難関私立校まで幅広い実績を残しています。
公立高校では、東葛飾高校や小金高校、柏南高校、県立柏高校といった東葛地域の難関・上位校へ毎年多くの合格者を輩出しています。また、つくばエクスプレスやJR武蔵野線という交通アクセスの良さを生かし、東京都内の私立高校や、芝浦工業大学柏高校、専修大学松戸高校、流通経済大学付属柏高校といった近隣の私立進学校へ進学する生徒も少なくありません。
地域塾の進学指導担当者によると、「南流山エリアは共働きで教育意識の高い世帯が多く、定期テストの平均点や提出物の完成度も非常に高い水準で推移している」とのことです。校内での健全な切磋琢磨が、高い進路実績を支える土台となっています。