現地を訪れるドライバーが最も陥りやすい落とし穴が「駐車場選び」です。兵庫県立淡路島公園にはAからFまで複数の巨大駐車場が点在しており、誤った場所に駐車すると目的地まで山道を20分以上歩かされる事態に直面します。
公共交通機関を利用する場合は、高速バスの利用が非常に快適です。JR三ノ宮駅、新神戸駅、大阪駅(阪急梅田・なんば)から運行している淡路島直通バス(かけはし号や北淡路西海岸ライン)を利用すれば、「ニジゲンノモリ」バス停、または「淡路ハイウェイオアシス」バス停まで乗り換えなしでアクセスできます。運転による疲労や高速料金・ガソリン代の負担を考慮すれば、少人数旅行において極めて合理的な選択肢と言えます。
また、気になる雨天時の対応についても押さえておく必要があります。ニジゲンノモリは屋外型の自然共生型パークであるため、雨天時はゴジラのジップラインやクレヨンしんちゃんのアスレチックが強風・豪雨により運行休止となるリスクを孕んでいます。一方で、『ドラゴンクエスト アイランド』はレインコートを着用すれば雨天でもプレイ可能であり、『ゴジラミュージアム』などの屋内展示施設は天候の影響を受けません。雨予報の日は、傘ではなく両手が自由になるポンチョやレインスーツを準備し、体験エリアを屋内外複合型に切り替える柔軟性が求められます。