島外からの主要なアクセス手段は海上交通です。そのため、滞在中のスケジュール管理において空の明るさ以上に重要なのが新上五島町の波の高さや風速です。長崎港や佐世保港を結ぶ船便は、波高や風速が一定の基準を超えると条件付き運航や欠航が発生します。
主要航路を担う九州商船の運航状況を注視する際、一般的には波の高さが2.5m〜3mに達すると高速船（ジェットフォイル）が欠航しやすくなり、3m〜4mを超えると大型フェリーも運航見合わせの判断が下される傾向にあります。ここで覚えておきたいのは、港の立地による海況の違いです。
島の東側に位置する有川港の天気予報では北東寄りの強風時に波が立ちやすく、南端に位置する奈良尾港の海の天気は南西からのうねりに敏感です。利用する港の風向と波浪予測を個別に把握しておくことで、新上五島町のフェリー欠航情報が出る前段階から代替ルート（長崎航路から佐世保航路への変更など）を想定できるようになります。
