ネットコミュニティや特撮ファンの間で頻繁に議論されるのが、『クレクレタコラ』における「封印回」「放送禁止エピソード」の真相です。全260話という膨大なエピソードの中には、地上波の再放送や一部のCS放送において長年ラインナップから外され、欠番扱いとなった回が存在します。
代表的な欠番エピソードとして知られているのが、第220話「頭をよくしようの巻」や第224話「ドッキリハウスの巻」などです。これらのエピソードが再放送で見送られた背景には、以下のような明確な理由が存在します。
当時の制作陣は過激なブラックユーモアを追求するあまり、精神医療や特定の疾患、身体的特徴を揶揄・連想させるようなアプローチを劇中に取り入れていました。頭部を直接改造して性格を改変しようとする描写や、精神疾患に対する差別的な俗称・ステレオタイプを誇張したパロディ表現が含まれていたため、1980〜1990年代以降の放送倫理基準（日本民間放送連盟の放送基準など）に照らし合わせた結果、局側の自主規制によって再放送リストから除外されることになりました。
しかし、単なる悪ふざけではなく、当時の映画会社が持っていた前衛的な表現意図を尊重すべきだという声も根強くありました。結果として、後年にリリースされた「クレクレタコラ コンプリートDVD-BOX」（東宝ビデオ）においては、「作品の歴史的価値とオリジナリティを尊重する」という配慮テロップを冒頭に挿入した上で、これらの欠番回を含む全260話が完全収録されるに至りました。闇に葬られたわけではなく、適切なコンテキストのもとでアーカイブ化がなされています。
