原作者ユニットである「あいだいろ」先生（ストーリー担当・作画担当）による原作漫画は、毎月18日発売の『月刊Gファンタジー』にて連載中です。物語は学園の七不思議を巡るコミカルな日常から一転、生と死、怪異と人間の残酷な境界線に踏み込む緊迫したクライマックス展開へと突入しています。
読者の間で熱い議論を呼んでいる「原作最新話 ネタバレ」考察では、かもめ学園の成り立ちや花子くん（柚木普）が生前犯した罪の真相、そして八尋寧々の寿命を巡るタイムリミットが最大の争点となっています。あいだいろ先生の公式X（@aidairo2009）では、毎月の連載告知に添えて描き下ろしイラストや制作の裏話が投稿され、読者の考察意欲を刺激し続けています。
単行本発売日のサイクルはおおむね4〜6ヶ月ペースで安定しており、特装版や小冊子付き限定版が発売されるたびに書店店頭やオンラインストアで即完売する現象が常態化しています。また、設定資料や秘蔵ネームを網羅した『地縛少年花子くん 公式ファンブック』やフルカラー画集は、作品世界をより深く理解するための必携アイテムとして、ファンの間で決定版としての地位を確立しています。
