神戸アンパンマンミュージアムを訪れる際、最初に把握しておくべきがチケット料金の変動価格制です。入場日（平日・土日祝・繁忙期）によって料金が異なり、1歳以上から大人と同額の2,000円〜2,600円（税込）が必要となります。1歳未満の乳児のみ無料です。
多くの来場者が検索する「割引クーポン」について、編集部が公式窓口および旅行代理店各社を調査した結果、一般向けの常設割引クーポンや前売り優待コードは存在しません。フリマアプリ等での転売チケットはQRコードの無効化リスクがあるため厳禁です。公的な割引としては、身体障害者手帳等をお持ちの方と同伴者1名に対する50%割引のみが適用されます。
入場には公式決済サイト（Webket）での「日時指定WEBチケット」の事前予約が必須です。希望日の7日前午前10時から販売が開始されますが、週末や連休の午前枠（10:00〜11:00）は販売開始直後に完売することも珍しくありません。スケジュールが決まり次第、受付開始と同時に枠を確保するスピード感が求められます。
