店頭で提供されるブルーボトルコーヒー メニュー 値段は、素材へのこだわりと抽出プロセスを反映した構成となっています。代表的なブレンド（ベラ・ドノヴァン、スリー・アフリカズ等）のドリップコーヒーをはじめ、季節ごとに世界各地の農園から届くシングルオリジン（単一産地銘柄）がラインナップされています。
特に人気を集めるのが、チコリ風味の水出しブレンドにミルクとオーガニックシュガーを加えた「ノラ（NOLA）」です。注文を受けてからアイロンで焼き上げる「リエージュ ワッフル」は、表面のキャラメリゼとモチモチした生地の食感が絶妙で、コーヒーとのペアリング体験を高めてくれます。
物販コーナーでは、ブルーボトルコーヒー 新宿 限定グッズやギフトアイテムが充実しています。有田焼の職人技で作られたシグネチャーの「清澄マグ」や、持ち歩きに便利なコミューターカップ、エコバッグなどは国内外の観光客から高い支持を得ています。バスタ新宿から長距離バスに乗車する前に、淹れたてのコーヒーと限定タンブラーをテイクアウトするスタイルは、新宿店ならではの定番利用法となっています。
