本作のエンディングを迎えるための唯一絶対の目標が、世界7つの海に眠る「覇者の証」をすべて集めることです。覇者の証は直接港や海上に浮いているわけではなく、海域ごとに「2枚の地図の断片」を入手し、それを合わせて完成する「古びた地図」に記された座標の海域を自力で探索・サルベージする必要があります。
覇者の証の入手手順は、大きく分けて次の3ステップで進行します。
ステップ1：海域の覇権確立と勢力値の獲得
各海域で第1位の勢力値（概ね1500〜2000以上）を達成するか、対立する敵対勢力を滅亡させることで、現地のギルドや酒場から協力を得られる状態を作ります。
ステップ2：儀礼アイテム・遺跡探索による「証の手がかり」回収
海域内の大都市でギルドの依頼（海賊退治、珍しい特産品の調達など）を達成すると、遺跡の場所が判明します。遺跡で特定の儀式を解き明かす、あるいは特定人物と接触することで1枚目の地図の断片が手に入ります。もう1枚は、同海域の特定港に特定航海士を連れて行くことで発生するサブイベントから入手します。
ステップ3：古びた地図の合成と海上サルベージ
2枚が揃うと自動的に合成され、詳細な地形図とバツ印が記された地図が完成します。測量士を配置した状態でその海域へ向かい、地図の地形を頼りに該当座標で「調査」コマンドを実行することで、晴れて覇者の証を獲得できます。
ここで多くのプレイヤーが直面するトラブルが、「アイテムや遺跡の座標が見つからない」「イベントが発生しない」という現象です。ネット上の座標一覧を見て該当地点へ向かっても、何も発見できないケースが頻発します。
その真相は、ゲーム内の「情報フラグの未解禁」にあります。『大航海時代IV』の宝物や遺跡は、酒場で情報を聞いたりギルドで手掛かりを入手したり、あるいは「特定の測量術レベルを持つ航海士」を配置していないと、たとえ正しい座標に到達しても反応しない仕様になっています。無駄足を防ぐためには、探索前に主要港のギルドで地図を購入し、酒場の女性にプレゼントを贈って親密度を最大化し、正確なヒントを引き出しておく段取りが欠かせません。
