爆発事案以降、ネット上では「宮崎空港の地下にはまだ多数の危険物が眠っているのではないか」という不安の声が散見されました。しかし、防衛省および国交省による物理探査データによれば、滑走路・誘導路下において通常運航に支障を及ぼす異常反応はすべて調査・処理済みであり、過度な不安は根拠を欠きます。
また、地方空港でありがちな「レンタカー受付の待ち時間問題」に関しても、宮崎空港特有の事情があります。敷地外の各社営業所までは車で数分の距離ですが、週末や大型連休の午前中には到着口のカウンターに長蛇の列ができます。事前にネット決済やクイックチェックイン手続きを済ませておかないと、出発まで30分〜45分のタイムロスが生じるリスクがあります。
アクセス面でのもう一つの盲点は、JR宮崎空港線の運行本数です。特急を含めると利便性は高いものの、時間帯によっては1時間に1〜2本程度の間隔になるスロットが存在します。飛行機の到着時間と列車の発車時間が合わない場合は、無理に駅で待つよりも、空港連絡バス（宮崎交通）を利用した方が市内中心部へ迅速に到達できるケースも少なくありません。
